Резидент ТОР получил статус МТК: какую ставку налога на прибыль применять

Минфин России в письме от 01.07.2026 № 03-03-06/1/56278 рассмотрел вопрос о применении пониженных ставок по налогу на прибыль организацией, которая одновременно является резидентом территории опережающего развития (ТОР) и включена в реестр малых технологических компаний (МТК). Разъяснения касаются порядка выбора налоговой ставки в соответствии с положениями Налогового кодекса.

Ведомство напоминает, что в соответствии с НК РФ резиденту ТОР предоставлено право выбора способа применения пониженных ставок. Первый способ предполагает применение пониженных ставок ко всей налоговой базе, если доходы от деятельности по одному из соглашений об осуществлении деятельности на ТОР составляют не менее 90% от общей суммы доходов. Второй способ — применение пониженных ставок к отдельной налоговой базе, сформированной от деятельности, выполняемой при исполнении соглашения, при условии ведения раздельного учета доходов и расходов.

В отношении малых технологических компаний действует иное правило: в 2025–2030 годах субъекты РФ могут устанавливать пониженную ставку по налогу на прибыль, подлежащему зачислению в региональные бюджеты, для организаций, включенных в реестр МТК.

Финансовое ведомство указывает, что резиденты ТОР и российские организации из реестра МТК — это две самостоятельные категории налогоплательщиков, для каждой из которых предусмотрены свой порядок и условия применения пониженных ставок. Следовательно, организация должна изначально выбрать категорию и применять ставки, установленные для этой категории, в течение всего периода, на который они введены.

Если резидент ТОР, уже применяющий пониженные ставки, впоследствии включается в реестр МТК, он может применять пониженные ставки для МТК только к налоговой базе, сформированной от иной деятельности, не связанной с выполнением соглашения о деятельности на ТОР. При этом если резидент ТОР применяет пониженные ставки ко всей налоговой базе, то применять ставки, установленные для МТК, он не вправе.